POSプログラムのバージョンによって、軽減税率への対応可否と対応方法が異なります。
下記バージョン確認方法をご覧いただき、お使いいただいているPOSのメニュー画面を操作して、バージョンを御確認ください。

FScompass V007.100 または V010.000～　が軽減税率対応となります。
それ以外のバージョンご使用の場合はバージョンアップが必要です(有償)。
10月1日には間に合わない可能性が高いです。